蓝氏贾第鞭毛虫病是由于感染虫体对机体产生的机械和化学作用，导致机体产生非特异性和特异性宿主反应。分布呈世界性，在前苏联特别严重，美国也接近于流行，发展中国家感染人数约为2.5亿。中国分布也很广泛，各地感染率0.48％～10％之间，儿童高于成人，夏秋季节发病率较高。