胃肠碱性反流可见于各种胃切除术，尤以毕氏Ⅱ式严重。胆汁和胰液反流入胃，长期刺激残胃黏膜，引起胃黏膜炎症、溃疡，随着时间的推移，可发生萎缩、肠腺上皮化生及不典型增生性演变，且与反流程度呈正比。胰液可能促使残胃内致癌物前体转变为致癌物而诱发癌变的发生，还有人证明单用牛磺胆酸能明显地促进亚硝基胍诱发残胃癌。