根
荞麦为直根系，有一条较粗大、垂直向下生长的主根，其上长有侧根和毛根。在茎的基部或者匍匐于地面的茎上也可产生不定根。根一般入土深度为30-50cm。
茎
大部分种类的茎直立，有些多年生野生种的基部分枝呈匍匐状。茎光滑，无毛或具细绒毛，圆形，稍有棱角，幼嫩时实心，成熟时呈空腔。茎粗一般0.4～0.6cm，茎高60～150cm，最高可达300cm。有膨大的节，节数因种或品种而不同，为10～30个不等。茎色有绿色、紫红色或红色。茎可形成分枝，因种、品种、生长环境、营养状况而数量不等，通常为2～10个。多年生种有肥大的球块状或根茎状的茎。
叶
叶包括叶片和叶柄。叶片呈圆肾形，基部微凹，具掌状网脉；叶柄细长。真叶分叶片、叶柄和托叶鞘三个部分。单叶，互生，三角形、卵状三角形、戟形或线形，稍有角裂，全缘，掌状网脉。叶片大小在不同类型中差异较大，一年生种一般长6～10cm，宽3.5～6cm，中下部叶柄较长，上部叶叶柄渐短，至顶部则几乎无叶柄。托叶鞘膜质，鞘状，包茎。
花序
为有限和无限的混生花序，顶生和腋生。簇状的螺状聚伞花序，呈总状、圆锥状或伞房状，着生于花序轴或分枝的花序轴上。
花
多为两性花。单被，花冠状，常为5枚，只基部连合，绿色、黄绿色、白色、玫瑰色、红色、紫红色等。
荞麦花(4张)雄蕊不外伸或稍外露，常为8枚，成两轮：内轮3枚，外轮5枚。雌蕊1枚，三心皮联合，子房上位，1室，具3个花柱，柱头头状。蜜腺常为8个，发达或退化。有雌雄蕊等长花型，或长花柱短雄蕊和短花柱长雄蕊花型。
阴阳平衡